星期一的當天晚上友誼賽正式拉開序幕。結果日本來到臺灣比賽的同學被一個犯罪集團的人員給抓走了，由於本多老師為了幫自己的妹妹加油，因此也被抓了。發生這件事情之後，警校的王牌小組和變小的刑警（包括世界的情報組織）一起去逮捕了犯人。逮捕完兇手之後，比賽繼續進行，隨著時間流逝，比賽終於結束了，由於比賽實在是太精彩了，於是日本選手和毛利蘭的朋友們（世良真純、遠山和葉）一行人一起參訪了臺灣的美麗風景。在參訪的過程中，遇到了黑暗組織的交友現場，於是被黑暗組織的人員給綁架了，結果這些人被綁架的時候，被餵下ATPX-4869的新版本，結果只有毛利蘭、世良真純、遠山和葉變小，其他人只是得到了尿失禁的問題，於是其他人包起了尿布。後來沒有變小的同學都跑來武藏野女子中學讀書。毛利蘭、世良真純、遠山和葉這三個人就回去了日本。回到日本之後，他們尋求阿笠博士的幫助，三個女生就來到了帝丹小學和柯南成為同班同學，並且和柯南一起住在工藤的豪宅裡，而且她們三個還得到日本警方、日本公安、MJIB、SIS、FBI聯合成立的證人保護計畫的幫助。也是因為這個證人保護計畫的關係毛利小五郎重新的回歸日本警方。她們一行人也有加入了少年偵探團，隨著時間的流逝，他們和少年偵探團的感情也越來越好。吉田步美的父母出國談生意，於是步美來到了工藤家和毛利蘭、世良真純、江戶川柯南、和葉一起生活。再一次的晚上步美突然尿床，結果其他女生也跟著尿床，後來那一天白天那四個女生又尿褲子，於是那天下午柯南帶著那四位女生去百貨公司買尿布，從百貨公司回來她們四個女生就過上包尿布的生活，結果和葉的消失導致她的在大阪的朋友很著急，於是開尋找的她的下落。