一切还得从一名天才家族的祖传研究开始：
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年历949年，被誉为机器人工学和能源动力学天才的教授兜十藏在其晚年于被我们称之为地球（Terra）的母星上的遗迹里挖掘出了钾合金（Japanium）矿石。
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并将其提炼成光子力能源和超合金Z这一新钢材材料后，成功贡献了一直沿用到如今却还是只能挖掘部分皮毛，但也足够支撑日常使用的各种“黑匣子”科技。
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如于我们长久演变以来成各种种族的亚人所构成的人类种族外增加了新生命体——拥有近似人类的思考回路，且能够自主学习进化的雷普利机器人（Repliroid 半机器人）。
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同时对于科技的推进也促进着大地上各种国家的联合组织的逐渐成立，并推行着联合组织制定大致政策，再下放到各处国家组织根据本地需求按点细调的做法。
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可就是这样的传奇科学家，却在三年后突然从人间消失一切踪迹，宛如“人间蒸发”了一样。只留下了仍在继续其研究的学生们还在钻研他的研究。
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其子兜剑造博士，便是一直着手着十藏关于究极机器人的设计，并在同年获得了仍继承着这一执念和光子力研究者独有的诅咒的儿子兜杰克。
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而兜剑造略微冷漠，又在给兜杰克留下另一个年幼弟弟后因科研事故害死了两人的母亲，只能将陪伴和教育儿子的工作交给友人弓弦之助和家族助理，初代雷普利机器人之一的密涅瓦X（后被杰克重命名为Kal'tist，凯尔希）的态度。
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让一直渴望获得父亲认可，却又埋怨和讨厌他的杰克认真设计了从他手中接过的“能够使人成为神或者成为魔”的最强机器人“魔神Z”（Mazinger Z）的图纸，并改写完善成了现今的白铁之城传说“魔神玉兰高达”。（Mazinger Zhephyranthes）
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可是，随着兜剑造和弓弦之助带头的光子力研究室对雷普利机器人不完善的科研，因电子大脑短路，程序问题过载等原因导致发生暴乱的“非正规品”（Irregular）雷普利机器人犯罪事件越来越多。
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为了应对这样的事件，953年，由一支雷普利机器人和部分人类组成的特殊警察部队“非正规品猎人”正式成立，并在各处国家都设有分部，专门处理这种暴乱机器人犯罪事件和部分普通亚人难以处理的事件当中。
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时历968年，大陆北方被划分为萨米的神秘区域因那里特有的次元裂隙，导致某个次元的邪魔大肆从中南下入侵大陆各处国家，魔爪也同时伸向刚开始进行的太空开发计划当中。
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就当非正规品猎人的出勤率因此达到历史最高峰时，某个一直潜伏在科学界阴暗面的阴谋家也在此时露出了自己的獠牙：即后人统称“地狱博士”的Dr.哈蒙德，以及他所发起的“地狱事变”。
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Dr.哈蒙德原先作为兜十藏仍在人世的最大挚友兼竞争对手，不仅最初两人对于机器人的看法存在严重分歧：
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即哈蒙德认为机器人不需要感情和拟人性，只需要作为工具使用即可。而兜十藏的雷普利机器人通人性和自我思考学习的能力则严重反驳了这点。
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且在兜十藏不告而别之后，自己的研究也在兜十藏的成果流通整片泰拉大地时遭受冷藏，这一点便彻底激怒了这另一个天才。
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满怀嫉妒的胜负欲和统治之心的他除了将古代遗迹中的机械巨人改造成机械兽，配合邪魔乱世发动侵略的同时，也制造了后世一切悲剧的起源。
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兜家和哈蒙德家的孙辈人士，兜杰克和费什·盖拉克缇克意识到他们所承受的祖辈之罪，并加入了猎人部队，开始奔赴各战线的最前线后。
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兜杰克却在阻止完萨米邪魔的入侵之时，被当时邪魔的领导者故意“赐福”了不死诅咒之罪。而兜杰克也在这样带着地狱之火归来的几天后，遭到了属于他的致命打击：
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作为兜剑造的最高杰作，非正规品猎人前第十七精锐部队队长的西格玛突然叛变成为非正规品。并在背刺完最信任自己的两位部下杰克和费什后，煽动了一大批前猎人进行革命叛乱。
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要从人类政权中独立出一个只有雷普利机器人的国家，并称其为“进化所需的牺牲”。而这背后的原因，则是Dr.哈蒙德针对光子力能源驱动的所有雷普利机器人特有的漏洞，所研制出来的光子力病毒带来的催化。
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兜杰克在此次行动后疑似“死亡”，并在之后的行动中，都只有兜剑造接收到儿子遗体后，因为察觉到上面仍未消散（实际为无法散去）的生命体征所再造出的雷普利机器人原型机“苍之洛克人X”了。
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战争期间，“洛克人X”兜杰克也为了拯救在地狱博士袭击下重伤的弟弟兜士郎，因为输血期间察觉自己的异样，和对父亲口头承诺的坚定奉行。
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决定在凯尔希（Kal'tist）的帮助下将士郎改造成的帮助下将士郎改造成和自己原理构造差不多，但却因为技术不完善导致只能做成跟高达很相似的黑狼机甲机器人继续活下去。
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而代号“赤之洛克人ZERO”的费什也在这于970年1月1日打出正式的一阵爆炸的“异常者战争”开端中同样为拯救已经成为半人半机械的兜杰克而第一次自爆牺牲。
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带着失去友人的痛苦，兜杰克也在同期驾驶着玉兰高达以高强度光子力射线的直击照射哈蒙德的座驾地狱王戈顿终止了哈蒙德博士的地狱事变和与西格玛的第一次死斗。
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但短短一年后西格玛突变成病毒态，并在同样在高浓度光子力射线照射下变化为电子生命体的“暗之帝王”形态哈蒙德博士的帮助下继续卷土归来。
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期间费什也在暗之帝王能够附身任何机器人作为载体的能力下，被迫因为暗之帝王对自己独有的外孙的“宠爱”，从而以强化后的拟雷普利机器人结构的原创机器人形态一起归队，但也为之后的宿命之战埋下了伏笔。
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之后，紧随着开发西格玛病毒抗体的多普勒博士反感染病毒叛变，由雷普利机器人组成的军队仲裁军团（RepliForce）被误判为非正规品。
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无奈为了维护自身军团成员的名誉和权利，将非正规品的戏码演到底，同样宣言要独立成机器人国度的事件。
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期间，仲裁军团为了补充战力而在大炎分部的新世代雷普利机器人研究——“岁兽”的暴走和非正规品猎人前来帮忙的处理也加快了这只能存于梦想中的机器人国度的幻想破灭。
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光子力研究所逐渐因这些误判淡出了非正规品猎人的决策舞台，而原就渴望和平解决的弓弦之助教授也因这种种错误判断卸下猎人参谋的职位，专心投入后方研究组的同时。
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让雷普利机器人西格纳斯成为了接下来的猎人总监，指挥引导将魔神高达所属权跟着一起彻底转到猎人部队下的兜杰克。
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975年，人类首个太空殖民地“Eurosia”（欧罗西亚）遭受受西格玛雇佣的神秘佣兵戴拿摩（Dynamo）的破坏，即将载着一整个殖民地的西格玛病毒砸向地球。
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非正规品猎人费什便搭乘载有炸药的太空梭，飞往殖民地内部引爆。虽然行动成功，费什也存活得救。但殖民地在大气层中的碎片还是对地球大地各处造成了不可磨灭的破坏。
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同时，困扰后世的各种名为“天灾“的灾难现象也疑似是因为这些碎片中所带着的西格玛病毒影响了当地环境，所正式产生。
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这次冲击也启发了人类科技线的又一进步。在与西格玛的又一次死斗之后，剩余的人类在建造了地底都市暂时避难的同时。由杰克所带头的雷普利机器人们也在地表上逐渐建起了名为“移动都市”的新项目。
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可三周之后的盖特梦魇事件，进一步加深了天灾的存在和影响程度的同时，也再度加深了已经经历了六七场大战，早就带些疲倦感的杰克的厌战心理。
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于是接下来的几年里，随着杰克突然提出自己暂时不想面对前线战斗的激烈争斗为理由，从而隐退二线专心于抗病毒程序的研发和通讯领航工作。
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非正规品猎人出现了明显的战力缺失，导致犯罪现象再度反弹飙升的同时，无意间使得不少独立企业有了慢慢崛起的机会。
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同时也有着名为“红色警戒”（Red Alert）的私警组织以过于暴力的手段擅自处理非正规品的传闻逐渐传开，只是最让杰克头疼的还是同时段兜士郎因为对大哥的态度和自己还是只能在整备班学习而闹脾气失踪。
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977年，随着兜士郎以“洛克人AXL”的名号突然出现在红色警戒中，并展现了新世代“复制型”雷普利机器人特有的“复制芯片”能力后叛逃出来。逃亡路上的小黑狼意外撞上正好在出勤的费什，便被带回家中。
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红色警戒也在这时正式向非正规品猎人发出挑战申请，而赌注正是浑然不知自己的新能力正被无数人觊觎的兜士郎。
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还没来得及处理家事的兜杰克也因为这次的挑战状被迫采纳西格纳斯总监的建议，让士郎替补自己的位置，成为打击红色警戒必不可缺的新人猎人。
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不过，虽然洛克人AXL的加入确实让非正规品猎人在这次战役中的救援率大幅度提升。可望着荧幕里战斗愈发吃力的挚友和弟弟，杰克还是咬咬牙放下了手上的文书工作，久违地拿起X-暴击枪回归前线。
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于是，在击败了获得了名为“导师”的神秘人物指点后性情大变的红色警戒伙伴们，兜士郎还是在发动自己的潜力让自身装甲能够变形成Destory Mode（毁灭模式）后打败了自己的师傅雷德（RED），
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并和两位哥哥一起打败了真实身份还是西格玛的“导师”。可惜这场战争结束后，不仅士郎要开始思考起自己战斗的意义，和大哥一直让他离开战场的理由。
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费什也开始回忆起这次战役中的一名红色警戒的头目，狙击食蚁兽对自己资料回路中的数据所做出的预言：“笼罩世界的虚伪之蓝和封印沉睡的破坏之红，这究竟是过去还是未来。”
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而杰克也在吐槽自己工作量又要增加时，依然不愿意认可自己淘气的弟弟为正式猎人。直到三年后，迎来了世界和历史的转折点......
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980年，随着人类政府再度重启对太空开发计划的重视，以名为“露明尼”（Lumine）作为代表的新世代雷普利机器人正式同复制芯片一起量产。
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可随着露明尼在杰克调查太空轨道电梯——贾科布（Jakob）附近的非正规品事件时被其曾经的宿敌霸法（VAVA）掳走，和新世代雷普利机器人的非正规化暴乱。
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使得杰克和猎人组织们一起怀疑该计划的正规性。（复制芯片能够肆意调用记录在过去资料里的所有雷普利机器