几年之后，共和国与分离主义之间的战争开始了，以黑暗面西斯领导的分离主义联邦带领着一支由各路科学家研发的克隆人、生物兵器和改造人组成的军团分庭抗礼。在多次和平谈判但被证实毫无用处后。为了维护共和国的统一并打击分离主义的嚣张气焰，新任的最高议长珂布为了太阳系的领土统一与和平立即通过了应急战争法案，并启动了一支由规模庞大的机器人军团和加拉尔霍恩的机动战士组成的共和国军奔赴战场，向分离主义者正式宣战！为了支援这支部队，共和国军征调了各个行星的巫师、麻瓜和野兽人居民作为辅助军来帮助大共和国军镇守后方、提供支援或清除战场上敌方的暗哨堡垒。深居于绝地圣殿，保卫了共和国千年的绝地武士也响应共和政府的召唤，与原力有着紧密联系的大师跟武士们被任命为共和国军的将军，他们的学徒被任命为机器人军的指挥官并领导着这支军队去对抗联邦军那扭曲的战争机器。但战争是残酷的，双方为了赢得战争的最后胜利不择手段，各种新式武器层出不穷地出现在战场上，据守后方的辅助军死伤惨重，前线战场更是成为了双方的绞肉机。和平遥遥无期，尽管中期双方都透露出了以和谈来结束纷争的倾向，但在意识形态上的不合与西斯的阴谋逼迫着双方再次刀剑相向，更暴露出了共和国官僚主义的弊端、绝地的保守和七星家族内部滋生的的腐败问题，从而加剧了各个星区人民对政府的不信任与对绝地和加拉尔霍恩抵触。长达四年的战争使得绝地武士、加拉尔霍恩和共和国的血液就要流干了，但在这场战争的第四年，在所有人的努力之下共和国终于迎来了胜利的曙光……
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在最为严格的行星防御系统，最精锐的的巫师辅助军、机器人兵和机动战士护卫下的首都星球蓝星无疑是整个太阳系内环区域最安全、最稳定、最富裕的同时也是其他饱受战争之苦的星球居民最向往的移民星球了。作为祖先地球方舟殖民者第一个扎根的星球不仅有着最深刻的文化、宗教底蕴，因为对这第一颗殖民星的重视，造就了蓝星发达的经济、政治、农业和工业基础。此时正是蓝星的早上八点，在蓝星繁华的首都区人们开始了他们一天的劳作，飞行扫把、魔毯和各式各样的飞行汽车基本上在空中被堵了个水泄不通，喇叭声、叫骂声与交警指挥交通那尖锐的哨子声此起彼伏，就像是一名喝醉了的乐队指挥家与一群摇滚歌手去演奏一曲杂乱无章的交响乐般，吵闹极了。交通车站跟地铁站那简直就是堵了将近半年的下水道，在站台上等待的人群挥汗如雨、前胸贴着后脊梁、脚尖对脚跟、肩膀对肩膀，穿着清一色的社畜装，手提公文包，艰难地在人海中移动，仅仅是为了在列车或公交到站后挤上车。列车、大巴进站开门的一瞬间人群就如决堤的洪水般一拥而上，站台工作人员则是竭尽全力尽可能多的把乘客塞进狭小的车厢里。当发车铃声响起时，塞满上班族的列车和大巴缓缓驶离了车站，仅留下大汗淋漓的工作人员和一群懊恼着没赶上车的社畜们。各个大楼的全息银幕上，穿着时髦性感的播报员报道着前线战场的最新动态以及共和国军所取得的战果，但播报最多的反而是在今天这个阳光明媚的日子郊游野餐、参观游玩所推荐的各大公园与景点。在前往学校与公司的路上，餐车的老板和员工正在为一群因晚起而急于赶去学校和公司的学生和员工们准备着早餐。骑着扫把的学生嘴里叼着面包，以风一般的速度直冲学校大门，以期望在上课铃响起之前赶到教室。而上班族们一边看着手腕上的手表，一边手忙脚乱地赶往公司以求老板不要扣工资。
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此时在清晨第一缕阳光的照耀下，首都中心的绝地圣殿熠熠生辉，当人们第一眼看去，那是一座巨大的梯形建筑物。如果近距离仔细观摩的话还会发现墙体上刻有一些古代的象形文字，据历史学家说是传说时代所有绝地武士始祖所留下的绝地真言。唯一的入口则是由两尊巨大的绝地圣像所把守的巨石大门，游客、官员与绝地武士都必须从这座宏伟的圣殿大门进出，以示对远古先人的敬畏。在绝地圣殿的外围区域，一名绝地武士作为向导带着一队游客参观着圣殿的展示区域并讲解着绝地的起源，300年前与加拉尔霍恩的创始人们驾驶高达共同对抗MA的历史。而在圣殿内部，一棵巨树在圣殿的中心区域茁壮地生长着，那正是绝地的发源地与圣所。在巨树之下绝地幼徒们跟随着他们的导师进行着基础的原力与剑术的修炼：所有孩子在导师细心的指导下笨拙地运用自己的原力把石子搭建成倒立的金字塔形状并努力保持该形态，光剑训练室的幼徒们统一佩戴着封闭感官的头盔，挥舞着手中的教学光剑小心翼翼地隔挡着训练球射出的弱化版等离子束。而圣殿二楼的图书馆中的绝地们井然有序地整理、编辑并小心维护着他们的知识宝库和象征着绝地未来的力敏儿童与绝地候选人名单。在圣殿的顶端