那一天，主人公八代目友人被闯入现实世界的纳菲力姆杀害。之后，他的意识到达了迪尔蒙，现实世界则处于植物人状态。
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迪尔蒙，一个以日本为原型的虚拟世界，这里有和日本一样的地方，也有不一样的。换句话说，就是赛博朋克的世界。
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这里的白天和黑夜的时间不能一样，否则会毁灭。因此，出现了两股势力。一个是掌管白天的Blue Angel（蓝色天使），简称BA，首领是天香院绫（假面骑士圣骑）。一个是掌管黑夜的Black Falcon（黑色猎鹰），简称BF，首领是一条寺游骑（假面骑士亿骑）。两股势力虽然会合作共同对敌，但也会出现互相干涉的现象。导致迪尔蒙有两种秩序。为此，绫一直在找机会除掉游骑。
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友人来到后，被纳菲力姆追杀，绫救了他。不过，纳菲力姆重生，找绫报仇，当绫敌不过时，友人使用莫名拿到的神启驱动器变身为假面骑士天启救了她。在了解迪尔蒙的事情后，友人打算留下来保护。但却让这里的白天和黑夜的时间变得一样了，也就是出了BUG。
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游骑因为友人抢了自己开发的驱动器和为了维护秩序视他为眼中钉，千方百计要弄死他。绫因为友人救过自己和自己身为改造人的身份决心帮助他，实际上是要利用友人，从而与游骑对抗，达到只有一个秩序的目的。在双方激烈的斡旋下，游骑开启了虫洞，让迪尔蒙崩溃的速度加快了，自己变成了BUG。可他并不后悔，先使用一连串的高科技手段报复失败后，再利用了绫的手下丽，但也以失败告终。友人对他的行为恨之入骨，升级后彻底打败了他。
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最终，游骑承认了友人，并和绫一起拯救迪尔蒙。此时，全球水位上升，一场末世的大洪水即将来临。要阻止那就必须消灭海洋纳菲力姆，三人合作消灭了它，迪尔蒙恢复了和平。随后，世界重启了……